En phytopathologie, les maladies racinaires sont des problèmes résultant de l'infection et de la colonisation des racines et du collet (base du tronc) d'une plante donnée par un pathogène (agent causal). Avec la colonisation interne des racines, un noircissement externe et une pourriture interne se produisent, empêchant l'absorption d'eau et de nutriments essentiels au bon fonctionnement de la plante. Donc, un autre terme technique est "la pourriture des racines".

En plus de ce symptôme local dans la racine, des symptômes se produisent également dans la partie aérienne, tels que le jaunissement de la couronne, le dessèchement des feuilles et des pointes, la chute des feuilles et même la mort de la plante. Parfois, l'arbre tombe à cause de cette pourriture. Dans les forêts, il existe plusieurs types de maladies des racines, qui peuvent être observées à la fois dans les forêts indigènes et plantées et dans les boisements urbains. L'impact principal est la mortalité des arbres touchés et leur chute. Voici quelques-unes des principales maladies:

Armillariose ou pourriture des racines par Armillaria:

L'armillariose est causée par des champignons du genre Armillaria, affectant un grand nombre de plantes ligneuses et survenant, au Brésil, principalement dans les arbres fruitiers (nèfle du Japon, pêcher, pommier et vigne) et dans les plantations de pins. Il n'y a pas de rapport dans l'eucalyptus. La maladie se manifeste souvent dans les plantations de pins âgées de un à huit ans, mais elle peut être observée sur des arbres de plus de 20 ans. Des pourcentages de mortalité entre 20 et 25% ont été estimés dans les zones de pin à forte infestation pathogène, dans le sud du Brésil, à la fin de 25 ans de rotation. L' espèce la plus sensible est Pinus elliottii variété elliottii, et sur une plus petite échelle de sensibilité sont Pinus caribaea, Pinus patula, Pinus radiata et Pinus taeda.

Les symptômes débutent par un jaunissement général des aiguilles, puis un tannage et un assèchement de la canopée qui précèdent la mort des arbres. La mort résulte de la destruction du système racinaire ou de l' annelage interne du collet de la plante et peut être accélérée en période de manque de pluie. Les signes s'observent sous la forme d'une exsudation intense de résine, qui s'accumule dans le sol, autour des racines, ou du tronc, formant une croûte de terre et de résine solidifiée.

Des plaques mycéliennes du champignon, de couleur blanchâtre, se forment sous l'écorce, depuis la base de l'arbre jusqu'à 4 mètres de hauteur. Cette croissance mycélienne est le signe le plus important pour le diagnostic de la maladie. Le champignon peut également former des rhizomorphes , structures filamenteuses semblables à des lacets, de couleur brun foncé, visibles à l'œil nu, mesurant 1 à 2 millimètres de diamètre, qui peuvent se trouver sur ou à l'intérieur de l'écorce.

L'agent pathogène a une large répartition géographique dans le monde, classé au Brésil comme Armillaria mellea , mais cette identification taxonomique était incorrecte dans les plantations de pins au Brésil. Des études récentes indiquent qu'il s'agit d'une autre espèce similaire. La maladie survient dans les zones récemment déboisées, où subsistent des résidus végétaux (racines et souches) qui fonctionnent comme source d'énergie pour le champignon et comme source d' inoculum.

La propagation du champignon dans le sol se fait par le mycélium et les rhizomorphes des restes de plantes ligneuses, comme les souches, les branches ou les racines. La mortalité des arbres a tendance à diminuer à mesure que la plantation vieillit, lorsque la source originale d' inoculum est épuisée, et les arbres deviennent plus résistants.

Pour le contrôle, il est recommandé que les zones récemment déboisées soient débarrassées et incinérées des résidus végétaux lors de la préparation du terrain pour la plantation. On sait peu de choses sur la résistance des pins contre Armillaria. La plantation d'espèces sensibles doit être effectuée dans des zones exemptes de l'agent pathogène ou ayant déjà été cultivées avec des plantes non hôtes de l'agent pathogène (cultures agricoles, pâturages et espèces forestières). Une autre recommandation est que la plantation soit faite avec des plants de bonne qualité, avec un système racinaire bien développé, dans un sol profond, sans la présence d'une couche d'obstacle. Les plantations doivent être correctement gérées, avec une taille et un éclaircissage appropriés, pour éviter de stresser les arbres et de les prédisposer à l'attaque d'Armillaria.

Association Phytophthora avec forêts:

l' oomycète Phytophthora est un agent pathogène avec une large distribution géographique, avec une importance économique et environnementale pour les cultures agricoles et les forêts plantées et indigènes. Elle a fait date en phytopathologie quand, au milieu du 19e siècle, elle a décimé les plantations européennes de pommes de terre et, indirectement, causé la mort de milliers de personnes sur ce continent.

Dans la littérature, les oomycètes sont connus sous le nom de faux champignons; cependant, en milieu de culture, ils leur ressemblent. Actuellement, les oomycètes sont classés dans un groupe appelé Straminipila. Il y a sept espèces signalées comme causant des maladies chez les espèces forestières au Brésil: Phytophthora boehmeriae, Phytophthora capsici, Phytophthora cinnamome, Phytophthora citrophtora, Phytophthora hévéa, Phytophthora nicotianae, Phytophthora palmivora, Phytophthora frigida et Phytophthora acaciae (espèce décrite dans l'acacia noir, en 2019). Dans cet article, nous nous concentrerons sur la maladie des gencives de l'acacia noir causée par Phytophthora.

L'acacia noir est une espèce forestière originaire d'Australie, principale source de tanins végétaux au monde. Au Brésil, l'acacia noir a été introduit dans l'État du Rio Grande do Sul dans les années 1930. En 2019, environ 75 900 hectares étaient plantés, impliquant environ 10 000 petits producteurs ruraux. La gommose est l'un de ses principaux problèmes phytosanitaires et est répartie dans toutes les zones de production du Rio Grande do Sul.

L' espèce Phytophthora nicotianae, Phytophthora frigida et Phytophthora acaciae cause la gommose et la pourriture du collet (base du tronc) des acacias noirs. Le sol est considéré comme la principale source d' inoculum primaire. Cette maladie cause des dégâts importants à la culture de l'acacia noir (jusqu'à 23% des arbres attaqués), en endommageant l'écorce, principalement dans les parties basale et médiane du tronc. En plus du Brésil, il se produit également en Afrique du Sud et dans les pays asiatiques.

La gommose est difficile à contrôler, et la stratégie la plus viable, à long terme, est la plantation d'arbres résistants. Il existe des mesures complémentaires recommandées, telles que: a) ne pas établir une nouvelle plantation dans une zone où la gravité de la maladie dans la plantation précédente était élevée; b) éviter les blessures aux plantes causées par l'équipement agricole; c) éviter les sols superficiels, mal drainés et sujets à l'engorgement; d) éviter d'enterrer une partie de la tige des plants lors de la plantation, ou de les ancrer dans le champ, pour les pratiques culturales ultérieures; e) utiliser des semis exempts de Phytophthora dans les nouvelles plantations.

De telles pathologies réduisent la productivité des forêts, à la fois en raison de la mortalité des arbres et du moindre développement des individus affectés. De plus, il existe un impact environnemental dû à la réduction du captage du dioxyde de carbone par la forêt, ainsi que l'émission de gaz à effet de serre due à la décomposition des plantes mortes.